Οι επιστήμονες ανακάλυψαν έναν νέο ιό στη Βραζιλία, το DNA του οποίου είναι το 90 τοις εκατό των γονιδίων άγνωστα στην επιστήμη. Τα αποτελέσματα της ανακάλυψης δημοσιεύονται στην τοποθεσία εκτύπωσης bioRxiv.
Ο ιός εντοπίστηκε στην τεχνητή λίμνη Pampulha στη βραζιλιάνικη πόλη Belo Horizonte. Το όχι πολύ περίπλοκο γονιδίωμά του αποτελείται σχεδόν εξ ολοκλήρου από άγνωστα στην επιστήμη γονίδια. Οι συγγραφείς ονόμασαν τον νέο ιό Yaravirus brasiliensis από τη νύμφη νερού Yara από τη μυθολογία των λαών της Νότιας Αμερικής.
Οι επιστήμονες εικάζουν ότι αντιμετωπίζουν την πρώτη περίπτωση άγνωστης απομονωμένης ομάδας ιών ή ενός μακρινού είδους γιγαντιαίου ιού που έχει εξελιχθεί σε μικρότερη μορφή.
Ανακαλύφθηκαν μόνο στον 21ο αιώνα, οι γιγαντιαίοι ιοί φτάνουν σε μεγέθη συγκρίσιμα με αυτά ενός βακτηριακού κυττάρου. Πήραν το όνομά τους λόγω των τεράστιων καψιδίων τους - πρωτεϊνικών μεμβρανών που περικλείουν ιοσωματίδια - ιικά σωματίδια. Έχουν επίσης DNA του κατάλληλου μήκους, το οποίο ξεπερνά τα 200 χιλιάδες ζεύγη βάσεων και συχνά περιέχει τα λεγόμενα ορφανά ή ορφανά γονίδια (ORFan), τα οποία δεν βρίσκονται σε καμία άλλη ομάδα οργανισμών.
Τα σύνθετα γονιδιώματα επιτρέπουν στους γιγάντιους ιούς να συνθέτουν πρωτεΐνες και ως εκ τούτου να πραγματοποιούν επιδιόρθωση, αντιγραφή, μεταγραφή και μετάφραση DNA. Πριν από την ανακάλυψή τους, πίστευαν ότι οι ιοί δεν έχουν τέτοιες ικανότητες, αφού είναι αδρανή πλάσματα που μπορούν να μολύνουν μόνο τους ξενιστές τους. Όλοι οι γνωστοί γιγαντιαίοι ιοί είναι παράσιτα των αμοιβάδων.
Και παρόλο που το μέγεθος του νέου μικροοργανισμού είναι σημαντικά μικρότερο από αυτό των γιγάντιων ιών - περίπου 80 νανόμετρα - παρασιτίζει επίσης στις αμοιβάδες και το γονιδίωμά του είναι σχεδόν εντελώς ορφανό: 68 από τα γονίδια του (πάνω από το 90 %) δεν βρίσκουν ανάλογα οποιονδήποτε γνωστό οργανισμό, και μόνο έξι αόριστα παρόμοια με αυτά που είναι γνωστά στην επιστήμη.
"Αυτό οφείλεται στο γεγονός ότι ο ιός είναι μια νέα γενιά αμοιβικού ιού με εκπληκτική προέλευση και φυλογένεση", δήλωσε σε δελτίο τύπου ένας από τους επικεφαλής της μελέτης, Jônatas Abrahão του Ομοσπονδιακού Πανεπιστημίου Minas Gerais στη Βραζιλία.
Οι επιστήμονες έχουν αναλύσει περισσότερα από οκτώμισι χιλιάδες μεταγονίδια, αλλά δεν έχουν βρει ανάμεσά τους ιούς που σχετίζονται με τον νέο μικροοργανισμό. Όπως και άλλοι ιοί αυτής της ομάδας, αντιπροσωπεύεται από δίκλωνο DNA, το μήκος του οποίου είναι 44.900 ζεύγη βάσεων και περιέχει 74 κωδικοποιητικά θραύσματα.
«Χρησιμοποιώντας τυπικά πρωτόκολλα, η πρώτη μας γενετική ανάλυση δεν μπόρεσε να εντοπίσει καμία αναγνωρίσιμη αλληλουχία καψιδίου ή άλλα κλασικά ιικά γονίδια στον γιαραϊό», εξηγεί ο Yonatas Abrajao και ο δεύτερος επικεφαλής της μελέτης Bernard La Scola του Πανεπιστημίου Aix-Marseille στη Γαλλία.
Σύμφωνα με τα επίσημα μεταγονιδιωματικά πρωτόκολλα, ο γιαραϊός δεν μπορεί καν να αναγνωριστεί ως ιικός παράγοντας, επειδή δεν έχει σαφή ομοιότητα με αυτούς. Οι επιστήμονες δεν μπορούν ακόμη να πουν τι πραγματικά είναι - εκπρόσωπος μιας εντελώς νέας ομάδας ή απόγονος ενός γιγαντιαίου ιού που με κάποιο τρόπο εξελίχθηκε σε μια μικρότερη μορφή.
"Ο αριθμός των άγνωστων πρωτεϊνών που αποτελούν τα σωματίδια του γιαραϊού αντανακλά τη μεταβλητότητα που υπάρχει στον ιικό κόσμο και πόσα νέα γονιδιώματα ιών δεν έχουν ακόμη ανακαλυφθεί", καταλήγουν οι συγγραφείς.
